أخبار ar.wedoany.com، أطلقت شركة NVIDIA مجموعة أدوات NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit، وهي حزمة أدوات متخصصة في مجال سير عمل الذكاء الاصطناعي لعلوم الحياة.
تدمج مجموعة الأدوات هذه المكتبات والأدوات والنماذج المفتوحة التي طورتها NVIDIA على مدى أكثر من عقد من الزمان في مجال علوم الحياة، بهدف مساعدة الوكلاء الذكيين والعلماء والمختبرات في معالجة البيانات العلمية، بما في ذلك جمع الأدلة وتحليل الاكتشافات وتشغيل التجارب الحاسوبية والتوصية بالخطوات التالية.
يمكن استخدام مجموعة الأدوات هذه كمساعد عام، ووكيل علمي، ومنصة برمجية، وأنظمة صيدلانية حيوية داخلية، حيث توفر أدوات لتلخيص المعرفة العلمية، واستدعاء النماذج، وتقييم النتائج، واستخلاص الاستنتاجات من الاكتشافات، وتنفيذ المهام اللاحقة.
تتضمن مجموعة الأدوات NVIDIA BioNeMo، وتعتمد على تقنيات الخدمات المصغرة NVIDIA NIM microservices، وNVIDIA Parabricks، وNVIDIA NeMo، وNVIDIA Nemotron، بالإضافة إلى أدوات الحوسبة المتسارعة.
يستخدم أكثر من 50 شركة مجموعة الأدوات هذه في سير عملها، والتي تشمل مجالات التنبؤ ببنية البروتينات، والالتحام الجزيئي، والكيمياء التوليدية، وتحليل الجينوم، وتصميم البروتينات، واكتشاف المؤشرات الحيوية.
تتعاون مؤسسات مثل Arc Institute، ومؤسسة Open Molecular Software Foundation، ومعهد تصميم البروتينات بجامعة واشنطن (University of Washington’s Institute for Protein Design) مع NVIDIA لتطبيق BioNeMo على نماذج البحث وجعلها متاحة من خلال سير العمل القائم على الوكلاء. وتشير NVIDIA إلى أن التعاون مع معهد تصميم البروتينات أدى إلى تحسين أداء نماذج مثل RosettaFold3 في وقت التشغيل، حيث بلغ الأداء حوالي ضعف أداء الجيل السابق من النماذج.
تنطوي أبحاث علوم الحياة على ميزانيات بحث وتطوير ضخمة للمؤسسات العلمية والصيدلانية. تساعد سير العمل القائمة على الوكلاء الباحثين على التكرار بشكل أسرع، وخفض التكاليف، وزيادة كفاءة العمل العلمي. وتوضح NVIDIA أن مجموعة الأدوات تسمح للمطورين بتكييف الوكلاء العامين لاستخدامات علوم الحياة، مما يساعد الباحثين على إجراء التجارب بشكل أسرع، والتعلم من النتائج، وتقصير الفترة بين الفرضيات والتحليل. وقد قامت بعض الشركات بتوسيع نطاق سير العمل هذا ليشمل بيئات المختبرات الفعلية.
قد تواجه الوكلاء العامون صعوبة في التعامل مع سير العمل العلمي، حيث يتعين عليهم استنتاج الأدوات والمدخلات والمخرجات والسياق البيولوجي الصحيح. وتؤكد NVIDIA أن BioNeMo Agent Toolkit مصمم لمساعدة الوكلاء على اختيار الأدوات المناسبة، وتفسير النتائج، ودعم التحليل العلمي.
تعمل NVIDIA على تعديل منصة BioNeMo بحيث يمكن للوكلاء استدعاء المكتبات والنماذج والأطر بشكل مباشر. ويشمل ذلك نموذج NVIDIA Nemotron المفتوح للاستدلال، ومكتبة NVIDIA NeMo RL للتعلم المعزز، ومخطط NVIDIA NemoClaw للوكلاء القادرين على التعاون في المهام، واستدعاء الأدوات، والتفاعل مع البيانات.
تُستخدم الخدمات المصغرة NVIDIA NIM microservices للوصول إلى النماذج وتنفيذ المهام. ويوفر بيئة تشغيل NVIDIA OpenShell بيئة تنفيذ لسير العمل هذه.
تشمل سير العمل التي تدعمها مجموعة الأدوات: الفحص الافتراضي، حيث يساعد الوكيل في تحديد المرشحين للأدوية الجزيئية الصغيرة من خلال توليد وفحص المركبات، وإلصاقها بالأهداف، والتنبؤ بقوة الارتباط، وتصفية خصائص الدواء، ثم يقوم النظام بترتيب المركبات المرشحة لمزيد من المراجعة؛ وتحليل الجينوم واكتشاف الأهداف، حيث يقوم الوكيل بمعالجة بيانات التسلسل لتحويلها إلى اكتشافات جينية وأهداف بيولوجية ذات أولوية، ويستخدم NVIDIA Parabricks للمقارنة واكتشاف الطفرات، وتقوم النماذج الأساسية للجينوم بتقييم تأثيرات الطفرات، ويقوم الوكيل بترتيب الأهداف المرشحة لمزيد من البحث؛ وتصميم روابط البروتينات، حيث يساعد الوكيل الباحثين على تصميم وتقييم المرشحين للروابط حسابياً قبل بدء العمل المخبري؛ وسير عمل الأبحاث الطبية الحيوية، حيث يربط الوكيل مصادر البيانات بنماذج الاستدلال لمهام مثل مراجعة الأدبيات، وتوليد البروتوكولات، وفحص التجارب السريرية، واليقظة الدوائية؛ وتحليل الصور الطبية، حيث يقوم الوكيل بمعالجة وتقسيم وتوليف وتحليل بيانات الصور الطبية لاستخدامها في سير عمل مثل اكتشاف المؤشرات الحيوية وتوليد الأدلة.
تستخدم الشركات في مجالي التكنولوجيا وعلوم الحياة مجموعة الأدوات هذه لسير العمل القائم على الوكلاء. يتعاون مطورو الوكلاء العلميون، بما في ذلك Anthropic وEdison Scientific وLila Sciences وOpenAI وOwkin، مع BioNeMo لدمجها في سير عمل البحث والتحليل. وتشير NVIDIA إلى أن نماذجها ومكتباتها التحليلية تساعد في تقصير الوقت بين توليد الفرضيات والنتائج.
تستخدم منصات البيانات والأدوات، بما في ذلك Benchling وCertara وDatabricks وSnowflake وSeqera، مجموعة أدوات BioNeMo Agent Toolkit لربط أنظمة البيانات العلمية بسير عمل الذكاء الاصطناعي. تساعد أدوات BioNeMo الوكلاء على الاستعلام عن مجموعات البيانات البيولوجية والكيميائية، وإعداد مدخلات النماذج، وبدء سير عمل قابل للتكرار، وتحليل المخرجات، وإرجاع النتائج داخل المنصات التي يستخدمها العلماء وفرق البيانات.
تستخدم شركات التشخيص والأدوية، بما في ذلك Lilly وNatera، مجموعة أدوات BioNeMo Agent Toolkit في سير عملها المتعلق بالاكتشاف والبحوث الانتقالية والتحليل السريري. تعاونت شركات الذكاء الاصطناعي المتخصصة في علم الأحياء، بما في ذلك Boltz وBasecamp Research وChai Discovery وDyno وPerturbAI وProxima، مع NVIDIA لتطوير أدوات سير عمل لتصميم العلاجات القائمة على النماذج. تقوم شركات برمجيات اكتشاف الأدوية، بما في ذلك Dassault Systèmes وCadence (OpenEye) وSchrödinger، بدمج وظائف مجموعة الأدوات في التطبيقات العلمية المستخدمة في سير عمل الاكتشاف، مما يمكن الوكلاء من تنسيق مهام توليد الجزيئات والالتحام والتنبؤ داخل بيئات البرامج الحالية. تستخدم شركات الأجهزة المختبرية والأتمتة، بما في ذلك Automata وHighRes وTecan وThermo Fisher وMedra، أدوات BioNeMo لربط الأنظمة المختبرية بسير العمل الحاسوبي. يستخدم مزودو البنية التحتية والسحابة للذكاء الاصطناعي، بما في ذلك Baseten وModal وNebius، مجموعة الأدوات لدعم سير عمل علوم الحياة المُدارة، حيث يوفرون واجهات برمجة التطبيقات (APIs) وبيئات الحوسبة والاستدلال المُدارة، بهدف دعم نشر التطبيقات القائمة على BioNeMo للباحثين والشركات.
مجموعة أدوات BioNeMo Agent Toolkit ومهاراتها متاحة الآن عبر صفحة موارد المطورين من NVIDIA وGitHub.
